甲状腺激素在维持女性生殖系统功能正常方面发挥着重要作用，因此甲减对育龄女性的最大影响是导致怀孕困难。有些甲减病情较轻的患者不影响怀孕，但流产或死胎率较高，由此可见甲减对于胎儿的危害。
甲减对胎儿的影响
甲减是可以遗传的，如果孕妇甲状腺功能减退，有可能影响孩子智力发育，因此，怀孕女性最好能在发现妊娠时进行一次甲状腺检查，如果在怀孕前就已经因为有甲状腺疾病而接受了治疗，那么怀孕期间，每6-8周应进行一次甲状腺的检查。
婴儿在出生3-5天后，一般医院会采婴儿的足跟血做常规筛查，来筛查呆小症。做了早期筛查，这种病完全可以治疗。但如果婴儿到了6周以上才发现有甲减，再去治疗就晚了。
孕妇甲减可造成胎儿严重智障，甲状腺激素是机体正常运转所必需的，12周内的胎儿发育所需的甲状腺激素完全来自母体，之后胎儿虽开始自己合成甲状腺激素但仍需依赖母体来保证激素水平充足。孕妇甲状腺激素分泌不足会影响孩子生长和智力发育，甚至引发呆小症(智力低下、身材矮小)等。对胎儿影响很大。
甲减到后期很容易和呆小症混淆，地方性的呆小症，胚胎时期孕妇缺碘是发病的关键。散发性的呆小症，多由孕妇患的某些自身免疫性甲状腺疾病引起，明确病因进行预防，母体妊娠期服用抗甲状腺药物尽量避免剂量过大，用是加用小剂量干甲状腺制剂，并避免其他致甲状腺肿的药物。
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