1.食物成分不当造成的便秘
造成宝宝便秘可能是摄入的食物成分不当造成的，如果食物当中含有大量蛋白质，但是碳水化合物不足，肠道菌群就会发生改变，肠内发酵过程少，大便就容易呈现碱性，变得干燥。而如果食物中含有的碳水化合物比较多，肠道发酵菌就会增多，发酵作用也随之增加，呈现的酸性多，大便容易呈现酸性，所以大便的次数会增多而软。而如果食入的脂肪和碳水化合物都高，那大便就会比较润利。所以在日常生活中，如果给小儿进食大量的钙化酪蛋白，会导致粪便中含有多量的不能溶解的钙皂，粪便增多并且容易便秘。小儿偏食、不喜欢吃蔬菜，喜欢吃肉也容易因为纤维素太少而发生便秘。
2.饮食不足造成的便秘
婴儿喝的母乳或奶制品中，如果奶中糖量不足会导致肠胃蠕动变弱，大便变得干燥。如果长时间饮食不足有可能会引起营养不良、腹肌和肠肌张力变低，甚至会发生萎缩，导致收缩力减弱，形成恶性循环，加重便秘。
3.肠道功能失常造成便秘
生活不规律或是缺乏按时大便的训练，会导致未形成排便的条件反射，继而导致便秘。学龄前儿童有可能会因为清晨无大便的情况，上课时间又不能随时排便，经常憋住大便也是导致便秘的常见原因之一。而一些常用泻剂或灌肠，缺少体力活动等也容易导致便秘。
小儿如有营养不良、佝偻病、高钙血症、皮肌炎、呆小病以及先天性肌无力等都会导致肠壁肌肉乏力，引起功能失常而便秘。除此之外，交感神经功能失常、腹肌软弱或麻痹也常常会导致便秘，服用一些药物也有可能会导致孩子肠蠕动减少而产生便秘，如抗胆碱能药物、抗酸剂、某些抗惊厥药、利尿剂和铁剂等。
4.体格与生理异常导致便秘
小儿发生肛门裂、肛门狭窄、先天性巨结肠、脊柱裂或是肿瘤压迫马尾等都有可能会引起便秘。如果是这种情况的话，应该进行肛门指检、下部脊柱和会阴部检查等。也有一些小儿发生便秘是因为家族遗传的关系。
5.精神因素导致便秘
小儿突然受到精神刺激、或是遭受环境和生活习惯的突变，这些都有可能会引起短时间的便秘。
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